转录辅助因子对各有不同类型的核心启动子具有特异性

2022-02-07 00:24:03 来源:

基因表达辅助因子（transcriptional cofactor， COF）在增强子与核糖两者之间传递信息调控线索，是基因表达基因表达和基因表达的当前效应器皿。虽然已属实某些COF比其他COF更倾向某些核糖型式，但是各有不同COF对各有不同核糖显示借助于的内在特异性的程度尚不似乎。在一项在此之后数据分析之前，来自奥地利维也纳生器皿之前心小分子病理学数据分析所的数据分析工作人员在黑腹果蝇S2肝细胞之前用于生物医学核糖活性测定来筛选23个COF基因表达7.2万个候选当前核糖（core promoter， CP）的能力。相关数据分析结果于2019年5月15日的网站发表在Nature期刊上，文章篇名为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些数据分析工作人员判读到当前核糖的差异性基因表达，这表明COF与特定型式的当前核糖两者之间共存着各有不同的调控倾向或者说“相容性（compatibilities）”。这些功能各有不同的当前核糖在TATA盒、下游核糖元件（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等值得注意的基因序列元件上相似性地富集，并在诱导肽链上显示借助于各有不同的体细胞特性。值得注意的是，这些当前核糖型式在它们的H3K4me3和H3K4me1记号上共存各有不同的相对丰度，这表明这些核糖去除显然只能区分环己烷调控因子而不是核糖和增强子型式的顺式调控元件。这些数据分析工作人员属实在人肝细胞和另外两种果蝇肝细胞之前属实了各有不同COF-当前核糖相容性的共存。为此，他们发现了分别倾向TATA盒和CpG岛上核糖的COF。COF和当前核糖两者之间的各有不同相容性只能阐释各有不同的增强子如何特异性地基因表达各有不同组成员的基因、不同基因内的MA核糖（alternative promoter）和不同核糖内的各有不同基因表达起始肽链。综上所述，COF-当前核糖相容性显然是果蝇和人类等各有不同类群之前各有不同基因表达程序的基础。零碎借助于处：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]