Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中寄生虫表观遗传标记的存在

2021-10-25 02:40:24 来源:
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导言:在更早阶段,自然界就开始了在不改变病菌细胞核DNA秘密组织顺序的前提下来使其DNA发挥并不相同的特性,而这就是通过给DNA氨基酸上添加化学标记来实现的。DNA丝氨酸是灵长类动物的不可或缺基因表达遗传基因机制,其当中5-酮酮化(5mc)是最常用的DNA粘贴之一。6mdA是病菌限制性粘贴系统的理论上组成成分,迄今在灵长类动物当中缺乏已知的限制性粘贴系统。早先有不少数据分析报道,6mdA也长期存在于灵长类动物当中,但并已对反对。

近日,在《生物科学进展》上的一项数据分析当中,比利时林雪平大学的数据分析管理人员说明了,灵长类动物细胞核当中长期存在病菌基因表达遗传基因标记很意味著被水污染了,并且没足够的证据来显然灵长类动物当中长期存在这种粘贴。

N6-酮鸟嘌呤(6mdA)是病菌当中广泛应用的DNA粘贴,但最近在灵长类动物DNA当中也给与了表征。然而,数据分析管理人员所述,即使对来自相异灵长类动物细胞核种类的DNA进行的6mdA分光镜和重元素测量数据分析也不一致。

为了全面性阐明6mdA在灵长类动物由此可知规格当中的作用,数据分析管理人员利用了体外将人类文明固执T专门设计(NTH)细胞核分化为TH细胞核亚群的能够。但是,与早先的数据分析相反,他们推断出TH分化处理过程当中6mdA的重元素没有序变化,并且观察到分化的T细胞核当中的6mdA电子技术水平与没丝氨酸的全基因组缩减DNA相异,这说明了6mdA并没以可探测的电子技术水平长期存在人类文明T细胞核当中。

他们还分析了从六个人类文明细胞核系当中分离出来的DNA当中的6mdA,并鉴别出两个具高于背景噪声电子技术水平的6mdA电子技术水平的细胞核系。出乎意料的是,两种单独的293T细胞核系培养物具并不相同的6mdA电子技术水平,这说明了数据分析管理人员观察到的6mdA频率并非细胞核种类本身固有的。确实,当他们全面性看时,他们推断出两条6mdA电子技术水平升高的细胞核系被芽孢旧属水污染,芽孢旧属一种常用的病菌细胞核培养物当中蕴含6mdA的水污染物。当他们用芽孢特异性抗生素Plasmocin处理细胞核系时,6mdA频率减小为A阳性相异。

“我们认识到通过这些电子技术探测到的6mdA'频率'只是噪声。但是,由于一些复杂的电子技术问题,几种原理当中的背景噪声不是随机的,而是真实频率。”见习写作者Colm Nestor(维斯姆·内斯特)在一份声明当中话说。

数据分析管理人员分析了在此之前通过DNA免疫沉淀DNA、质谱和单水分子实时DNA在灵长类动物细胞核当中聚焦或探测6mdA的努力。人们推断出每种原理都有显然或显然,使基因表达遗传基因标记的真阳性推断出率很高,似乎说明了林雪平数据分析管理人员认为不长期存在这种成因的证据。

这组写作者所述:“我们显然,RNA和病菌水污染、抗体交叉底物性和其他电子技术限制的结合已所致6mdA在灵长类动物DNA当中的反复偏差辨别。随着DNA和RNA粘贴家族的不断增长,以及在此之前没知粘贴的突显日渐罕有,即使应用于多种互补原理,我们也强调了偏差推断出的意味著性。我们同意应用于粘贴和没粘贴的基因组DNA标准作为今后对稀有DNA粘贴的数据分析的高于要求,以及在应用于前更全面地验证抗体特异性。”

内斯特缺少话说,数据分析管理人员在数据分析非常罕有的成因时需要非常小心,选择应用于哪种原理,并考虑他们前提真正在衡量长期存在的想像。他话说:“现在我们可以或许地话说灵长类动物当中不长期存在6mdA。关于6mdA,如果数据分析管理人员停止数据分析根本不长期存在的东西,则可以节省大量时间和花钱,并且避免了很多令人失望的什么事。”

类似出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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